Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kdm2aP59997 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kdm2aP59997 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms