Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 960 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fgd1P52734 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fgd1P52734 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fgd1P52734 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fgd1P52734 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fgd1P52734 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Fgd1P52734 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fgd1P52734 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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