Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ube2e3P52483 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms