Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtshP49935 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtshP49935 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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