Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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