Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SrprbP47758 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SrprbP47758 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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