Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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