Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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