Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprkP35822 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprkP35822 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms