Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TpoP35419 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TpoP35419 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TpoP35419 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TpoP35419 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TpoP35419 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TpoP35419 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TpoP35419 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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TpoP35419 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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TpoP35419 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TpoP35419 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms