Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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