Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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