Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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