Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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