Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms