Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gja1P23242 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms