Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ms4a2P20490 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ms4a2P20490 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ms4a2P20490 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ms4a2P20490 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ms4a2P20490 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ms4a2P20490 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms