Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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