Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms