Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms