Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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