Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RhoP15409 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RhoP15409 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RhoP15409 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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