Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Irf1P15314 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Irf1P15314 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Irf1P15314 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Irf1P15314 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Irf1P15314 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Irf1P15314 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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