Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P10404 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P10404 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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