Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb4P10284 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms