Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01667 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01667 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01667 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms