Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mtatp6P00848 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms