Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms