Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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