Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms