Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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