Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim22J3QP37 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smim22J3QP37 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim22J3QP37 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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