Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm20828J3KMI7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms