Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nccrp1G3X9C2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nccrp1G3X9C2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nccrp1G3X9C2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nccrp1G3X9C2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Nccrp1G3X9C2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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