Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms