Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms