Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms