Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ambra1A2AH22 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms