Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms