Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm2A2A7B5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms