Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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