Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms