Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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