Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PplQ9R269 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PplQ9R269 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms