Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms