Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms