Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tgm1Q9JLF6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tgm1Q9JLF6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tgm1Q9JLF6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tgm1Q9JLF6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tgm1Q9JLF6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tgm1Q9JLF6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Tgm1Q9JLF6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Tgm1Q9JLF6 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tgm1Q9JLF6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tgm1Q9JLF6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tgm1Q9JLF6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tgm1Q9JLF6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms