Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms