Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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