Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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